Показания к озонотерапии в гинекологии:
острые и хронические воспалительные заболевания женской половой сферы (метроэндометриты, кольпиты, бартолиниты, пельвиоперитониты, сальпингоофориты идр.)
генитальный герпес
профилактика различных послеоперационных осложнений и реабилитация больных в послеоперационный период
заболевания, передающиеся половым путем.
Обильные кровотечния являются противопоказанием к озонотерапии, мажущиеся кровянистые выделения и склонность к геморраргиям требуют тщательного контроля.
Применение озонотерапии в акушерстве способствует улучшению кислородтранспортной функции крови, усиливает отдачу кислорода тканям, восстанавливает гемоглобин до нормальных цифр, повышает уровень сывороточного железа, усиливает кровоснабжение в маточно-плацентарных сосудах, способствует динамическому равновесию перикисного окисления липидов и процессов, происходящих в антиоксидантной системе, вызывает снижение вязкости крови, повышает способность к деформации эритроцитов, улучшает микроциркуляцию и транскапилярный обмен. Оптимизирует кислородный режим, обменные процессы, нормализует тканевой метаболизм. 
Применяется в акушерстве при: 
невынашивании беременности, 
раннем токсикозе, 
анемии беременных, 
фетоплацентарной недостаточности, 
гестозе, 
ожирении, 
внутриутробной инфекции.
Наиболее эффективна озонотерапия в конце первого – начале второго триместра беременности.